Hernández Hernández inició su trayectoria arbitral en las categorías inferiores del fútbol español y avanzó progresivamente. Debutó en Segunda División B en la temporada 2004‑2005 y posteriormente en Segunda División en 2007‑2008. Su ingreso a la Primera División (La Liga) se produjo el 20 de agosto de 2012, en un encuentro entre Real Zaragoza y Real Valladolid, marcando el comienzo de una extensa carrera en la élite del arbitraje español.
Desde enero de 2014 es árbitro internacional FIFA, lo que le permite dirigir encuentros de selecciones nacionales y de clubes en competencias bajo el paraguas de la FIFA y la UEFA. Además, ha sido promovido a la categoría élite de árbitros de la UEFA, un reconocimiento que lo ubica entre los colegiados más destacados del continente europeo.
A lo largo de su carrera ha acumulado más de 320 partidos dirigidos en competiciones oficiales, incluyendo La Liga, torneos europeos como UEFA Champions League, Europa League y UEFA Nations League, así como encuentros de clasificación de torneos continentales. Las estadísticas reflejan un promedio disciplinario estricto, con una media superior a cinco tarjetas amarillas por partido y más de cien penales señalados en diferentes competiciones.
Hernández Hernández también ha participado como árbitro o en funciones de VAR en eventos globales de primer nivel: fue designado como árbitro asistente de video en el Mundial de Qatar 2022 y en la Copa Mundial Femenina de la FIFA en Australia y Nueva Zelanda 2023, integrando equipos arbitrales de alto perfil internacional.
Dentro de España, su reputación se vio reforzada cuando la Real Federación Española de Fútbol lo eligió como el mejor árbitro del país en 2017 por el comité técnico de árbitros. Su ejercicio profesional lo ha llevado a dirigir clásicos del fútbol español y encuentros con gran exposición mediática, consolidando su posición como una de las figuras más relevantes del referato nacional en la última década.
En su desarrollo profesional, Hernández Hernández ha mostrado consistencia y adaptación a los cambios del arbitraje moderno, manteniéndose activo en los principales torneos del continente y representando al arbitraje español en escenarios internacionales con regularidad.